BLAST

BLAST es una herramienta que encuentra regiones de similitud entre secuencias biológicas. El programa compara secuencias de nucleótidos o proteínas con bases de datos de secuencias y calcula la importancia estadística. 

                                                                                 

                                                                            

¡ NOS PERMITE HACER ALINEACIONES ! 

¿Cómo se hacen los alineamientos en BLAST?

1. Para acceder a BLAST, debemos entrar a la base de datos NCBI donde nos da el acceso directo.
2. Debemos obtener las secuencias a alinear, estas se pueden extraer de la base de datos NCBI. 
3. Dependiendo si queremos comparar nucleótidos o proteínas, seleccionamos "blastn" o "blastp".
4. A continuación, el programa nos muestra los apartados donde se deben colocar las secuencias a alinear, en el primero se coloca la secuencia de consulta y en el segundo la(s) que queremos alinear con la anterior.
5. Una vez colocadas las secuencias, se presiona el botón "BLAST" y nos arroja los resultados. Nos dice el porcentaje de similitud, E value y nos muestra gráficamente el alineamiento. 

BLAST nos permite crear arboles filogenéticos al alinear la secuencia de distintas especies, esto nos permite conocer la relación evolutiva entre los distintos taxones.